Tomcat с самого начала имел ограниченные ударные возможности, но от их использования отказались еще на раннем этапе эксплуатации. В 1990-х годах, когда потребности ВМС в ударных машинах резко возросли, вариант "Bombcat" получил второе рождение.

Выбор оружия "воздух-земля" для удара по цели и способа его применения возлагался на офицера-оператора, но само боевое применение было исключительной прерогативой пилота. Самолет мог нести бомбы и ракеты в различных сочетаниях, а общая масса боевой нагрузки достигала 6577 кг.

Для подвески разнообразного вооружения были разработаны предварительно снаряжаемые держатели, что резко сократило время подготовки самолета к вылету. На узлах подвески самолет теперь мог нести или ракеты AIM-54, или держатели для бомб. Держатель устанавливался на свое место с помощью встроенного в узлы подвески подъемного механизма.

В варианте с обычным ударным вооружением самолет мог нести 10 бомб Мк 82 калибра 226-кг и пару ракет "воздух-воздух" AIM-9 для самообороны. Другой вариант вооружения включал бомбы Мк 84 и две ракеты AIM-54. Введение в середине 1996 года контейнера прицельно-навигационной системы LANTIRN позволило F-14 использовать высокоточное оружие - GBU-12 и GBU-16.

Обычно в ударном варианте самолет нес две такие бомбы с лазерным наведением. Позднее, когда на вооружение был принят контейнер системы целеуказания Litening II, оснащенный оптическим датчиком, лазерным целеуказателем и усовершенствованной системой инфракрасного обзора FLIR, он успешно использовался во время операций в Афганистане и Ираке.

В 2004 году компьютер системы управления вооружением Tomcat был запрограммирован на использование новых высокоточных 227-кг боеприпасов GBU-38 JDAM. Это позволяло самолету, несущему GBU-38 и GBU-12, наносить высокоточные удары в любой тактической обстановке и при любых погодных условиях.